图书介绍
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- 王延峰，崔光照著 著
- 出版社： 北京：电子工业出版社
- ISBN：9787121213243
- 出版时间：2013
- 标注页数：200页
- 文件大小：59MB
- 文件页数：210页
- 主题词：脱氧核糖核酸－计算方法－编码－设计
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图书目录
第1章 DNA计算1
1.1 DNA计算的出现2
1.2 DNA计算的研究进展4
1.3 DNA计算的实现方式11
1.4 DNA计算的基本思想12
1.5 DNA计算研究所面临的问题13
第2章 与DNA计算相关的分子生物学基础14
2.1 DNA的理化性质15
2.1.1 DNA的化学组成15
2.1.2 DNA的结构及特点16
2.1.3 DNA的变性与复性21
2.2 DNA杂交反应的热力学基础23
2.2.1 基本的热力学参数23
2.2.2 反应自由能变化△G23
2.2.3 △G0与△H0、△S0和温度的关系24
2.2.4 浓度对△G的影响24
2.2.5 △G，△H，△S和Keq的温度依赖性25
第3章 DNA计算中的编码问题28
3.1 DNA计算中的编码问题28
3.1.1 DNA编码问题的定义29
3.1.2 DNA编码的非规范几何结构29
3.1.3 规范几何结构的数学模型31
3.2 DNA编码的分子生物学约束32
3.2.1 物理约束33
3.2.2 热力学约束34
3.3 DNA编码问题的研究现状36
第4章 基于随机产生实时过滤算法的DNA编码序列设计42
4.1 设计思想42
4.2 DNA编码序列设计43
4.2.1 （Ⅰ）类约束条件43
4.2.2 （Ⅰ）类约束条件的排序49
4.2.3 （Ⅱ）类约束条件49
4.3 结果与讨论51
第5章 基于组合权重的DNA编码序列集合评价模型55
5.1 系统评价56
5.1.1 系统评价的定义及步骤56
5.1.2 评价指标体系57
5.1.3 权重59
5.2 DNA编码评价指标的建立61
5.3 DNA编码序列集合评价模型63
5.3.1 基于组合权重的综合评价模型63
5.3.2 约束条件之间的相关性63
5.3.3 权重系数的确定方法63
5.4 结果与讨论64
第6章 基于改进Hopfield网络算法的DNA编码序列设计66
6.1 MNCP是NP困难问题67
6.1.1 图的最大团问题67
6.1.2 MNCP可映射为MCP67
6.2 Hopfield网络69
6.2.1 离散型Hopfield网络69
6.2.2 连续型Hopfield网络70
6.2.3 Hopfield网络与优化计算70
6.3 DNA编码序列设计71
6.3.1 神经元内电位更新模式的改进72
6.3.2 基于改进Hopfield网络算法的MCP求解73
6.3.3 算法实现74
6.4 结果与讨论74
第7章 基于模拟退火遗传算法的DNA编码序列设计79
7.1 模拟退火遗传算法80
7.1.1 模拟退火算法80
7.1.2 遗传算法83
7.1.3 模拟退火算法与遗传算法的混合策略85
7.2 DNA编码序列设计86
7.2.1 问题描述86
7.2.2 算法实现88
7.3 结果与讨论89
第8章 基于文化遗传算法的DNA编码序列设计91
8.1 文化算法92
8.1.1 文化算法的计算框架92
8.1.2 文化算法的理论介绍93
8.1.3 文化算法的实现步骤100
8.2 DNA编码序列设计101
8.2.1 问题描述101
8.2.2 算法实现102
8.3 结果与讨论104
第9章 基于改进NSGA-Ⅱ的DNA编码序列设计107
9.1 非支配排序遗传算法108
9.1.1 多目标优化问题的定义及相关概念108
9.1.2 非支配排序遗传算法109
9.1.3 带精英策略的非支配排序遗传算法111
9.2 DNA编码序列设计114
9.2.1 数学模型114
9.2.2 约束条件的处理114
9.2.3 算法实现115
9.3 结果与讨论117
第10章 基于混合蚁群算法的DNA编码序列设计120
10.1 蚁群算法121
10.1.1 蚁群算法的基本原理121
10.1.2 蚁群算法的逻辑结构123
10.1.3 蚁群算法的模型123
10.1.4 蚁群算法的实现步骤126
10.2 DNA编码序列设计127
10.2.1 构造城市群127
10.2.2 蚂蚁的转移规则127
10.2.3 路径评价128
10.2.4 交叉和变异操作129
10.2.5 算法实现129
10.3 结果与讨论130
第11章 基于剪枝优化算法的DNA编码序列设计132
11.1 搜索算法与剪枝优化133
11.1.1 搜索方法133
11.1.2 剪枝优化135
11.2 DNA编码序列设计137
11.3 结果与讨论139
第12章 基于粒子群优化算法的DNA编码序列设计144
12.1 粒子群优化算法145
12.1.1 标准粒子群优化算法145
12.1.2 粒子群优化算法的改进策略147
12.1.3 常用的测试函数151
12.2 DNA编码序列设计151
12.2.1 设计思想152
12.2.2 约束条件的选择152
12.2.3 适应度函数的建立152
12.2.4 算法实现153
12.2.5 结果与讨论153
12.3 基于四进制离散粒子群优化算法的DNA编码序列设计154
12.3.1 二进制粒子群优化模型154
12.3.2 四进制粒子群优化模型155
12.3.3 问题描述155
12.3.4 算法实现156
12.3.5 结果与讨论157
第13章 基于改进人工鱼群算法的DNA编码序列设计159
13.1 人工鱼群算法160
13.1.1 人工鱼群算法的基本原理160
13.1.2 人工鱼群的行为描述160
13.1.3 人工鱼群算法的数学模型161
13.1.4 人工鱼群算法描述163
13.1.5 人工鱼群算法的寻优机制分析164
13.2 DNA编码序列设计166
13.2.1 数学模型166
13.2.2 改进的人工鱼群算法167
13.2.3 算法实现169
13.3 结果与讨论169
第14章 基于野草算法的DNA编码序列设计172
14.1 野草算法173
14.1.1 野草特性173
14.1.2 野草算法174
14.1.3 野草算法的收敛性分析175
14.1.4 野草算法的相关研究178
14.2 基于野草算法的DNA编码序列设计179
14.2.1 数学模型179
14.2.2 算法实现181
14.3 结果与讨论181
参考文献184