图书介绍
生物序列突变与比对的结构分析PDF|Epub|txt|kindle电子书版本网盘下载
- 沈世镒著 著
- 出版社： 北京：科学出版社
- ISBN：7030133889
- 出版时间：2004
- 标注页数：354页
- 文件大小：12MB
- 文件页数：365页
- 主题词：蛋白质－序列－分析－数学模型；核酸－序列－分析－数学模型
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图书目录
目录3
第一部分 序列突变与比对的结构模型3
第一章 序列突变与比对问题3
§1.1 序列突变与比对问题概述3
§1.2 序列的突变与比对问题的基本模型10
§1.3 序列的比对的动态规划算法要点16
§1.4 多重序列比对问题简介20
§2.1 生物序列的随机性22
第二章 生物序列与序列突变的随机模型22
§2.2 突变发生随机流26
§2.3 由Ⅰ型突变所产生的随机序列31
§2.4 由Ⅱ型突变所产生的随机序列37
§2.5 由Ⅲ、Ⅳ型突变所产生的随机序列44
第三章 序列重组的数据结构分析49
§3.1 序列重组问题概论49
§3.2 二重序列的扩张与压缩60
§3.3 多重序列的包络与核67
§4.1 序列比对的模结构78
第四章 序列突变与比对的模结构理论78
§4.2 序列的突变的结构分析86
§4.3 序列突变的运算问题96
§4.4 二重序列比对的误差分析108
第二部分 序列的比对算法与结构分析121
第五章 二重序列比对的统计判决算法121
§5.1 SPA算法的目标与原理121
§5.2 SPA算法的基本步骤与改进126
§5.3 SPA算法的若干指标分析133
§5.4 序列比对算法的应用与实例分析146
第六章 多重序列的两两比对问题153
§6.1 多重序列比对与多重序列的两两比对问题153
§6.2 由多重序列的两两比对所产生的拓扑度量空间154
§6.3 序列进化的拓扑距离图159
§6.4 序列结构的聚类分析166
第七章 多重序列的突变与比对问题172
§7.1 多重序列的突变与比对的优化准则172
§7.2 多重序列快速比对的一个实现方案186
§7.3 多重序列的突变类型分析196
§7.4 多重序列的突变类型分析（续）204
§7.5 多重序列比对结果的实例分析208
第八章 蛋白质序列结构分析概论219
§8.1 蛋白质序列结构分析问题219
§8.2 蛋白质序列比对与结构分析要点221
附录A 概率与统计的基本知识231
§A.1 随机事件与随机变量231
第三部分 附录231
§A.2 几种重要的随机变量和它们的概率分布242
§A.3 随机变量的极限定理252
§A.4 统计分析简介256
附录B 随机过程理论简介263
§B.1 随机过程的一般理论263
§B.2 独立随机序列270
§B.3 泊松过程与可加过程277
§B.4 Markov过程281
§B.5 更新过程与更新理论287
§B.6 复合更新过程与排队过程296
附录C 图论的有关知识304
§C.1 图的一般定义与性质304
§C.2 无向图的结构与性质313
§C.3 有向图的结构与性质323
§C.4 拓扑距离图334
附录D 二重与多重序列比对的两个实例数据337
§D.1 两个RNA序列的比对问题337
§D.2 一组RNA序列的多重比对问题339
附录E 有关记号及说明341
§E.1 有关集合、元素、向量与序列的记号341
§E.2 有关随机变量的有关记号342
§E.3 重要随机过程记号346
§E.4 随机突变模型347
§E.5 序列扩张、比对与突变的模结构记号347
§E.6 有关图论的记号349
参考文献351