图书介绍
基于WWW的生物信息学应用指南PDF|Epub|txt|kindle电子书版本网盘下载
- 李桂源，钱骏主编 著
- 出版社： 长沙：中南大学出版社
- ISBN：7810618431
- 出版时间：2004
- 标注页数：325页
- 文件大小：245MB
- 文件页数：333页
- 主题词：因特网－生物信息论－情报检索－指南
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图书目录
第1章 引论1
1.1基因组／蛋白质组信息学2
基因组信息学2
蛋白质组信息学4
1.2互联网与生物信息学4
互联网基础5
生物信息学数据库16
生物信息学软件29
1.3生物信息学门户网站30
美国国立生物技术信息中心31
欧洲生物信息研究所32
瑞士蛋白质分析专家系统35
北京大学生物信息中心37
第2章 序列查询和递交39
2.1 Entrez查询系统40
简介40
Entrez系统的基本查询功能42
查询策略46
2.2 LocusLink查询系统58
2.3 SRS查询系统63
2.4序列信息递交70
第3章 序列相似性搜索81
3.1概述81
序列相似性与同源性82
全局和局部序列比对82
比对分数矩阵和空位罚分83
比对算法88
比对分数的统计学评价90
3.2序列相似性搜索91
BLAST93
Fasta112
第4章 基因识别121
4.1基因组外显子预测121
从头预测122
相似性比较预测131
4.2基于EST的基因鉴定143
第5章 多序列比对155
5.1 ClustalW156
5.2 BOXSHADE166
第6章 蛋白质基序和结构域识别170
6.1 PROSITE patterns和PROSITE profile172
6.2 Pfam和Prodom178
6.3 SMART183
6.4 Blocks和PRINTS185
6.5 InterPro190
第7章 进化树构建194
7.1 PHYLIP软件包196
7.2 ClustalW程序202
第8章 蛋白三维同源模型构建205
第9章 基因数字化差异表达分析212
第10章 核苷酸序列的一般分析224
10.1序列格式转换224
10.2互补和反向序列的转换227
10.3核苷酸序列统计228
10.4序列注释229
10.5序列翻译与ORF预测232
EBI的Transeq232
ExPASy的Translate tool234
ORF识别234
10.6限制性酶切分析240
10.7质粒作图245
10.8引物设计249
通用引物在线设计程序Primer3251
简并引物在线设计程序GeneFisher254
第11章 蛋白序列的其他特征分析262
11.1氨基酸基本理化特性分析263
11.2蛋白的亚细胞定位265
11.3膜蛋白跨膜区预测270
11.4蛋白序列二级结构预测274
JPred预测服务器277
PredictProtein预测服务器280
第12章 整合的序列分析288
12.1 EMBOSS系统289
12.2 Biology WorkBench293
12.3 BCM Search Launcher297
12.4 SeWeR303
12.5 JaMBW307
12.6 SMS308
第13章 蛋白质组信息学310
13.1蛋白质组与蛋白质组学310
13.2蛋白质组研究的理论和实践311
13.3蛋白质组学与蛋白质组信息学314
13.4蛋白质组分析的内容和方法316
13.5蛋白质组信息学相关资源322
13.6我国蛋白质组研究进展324