图书介绍
多标记生物数据建模与预测方法的研究PDF|Epub|txt|kindle电子书版本网盘下载
- 王晓著 著
- 出版社： 上海：同济大学出版社
- ISBN：7560868608
- 出版时间：2017
- 标注页数：111页
- 文件大小：13MB
- 文件页数：128页
- 主题词：
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图书目录
第1章 绪论1
1.1 多标记数据建模与预测概述1
1.1.1 形式化定义2
1.1.2 性能评价指标2
1.1.3 多标记数据建模预测算法回顾6
1.2 多标记生物数据分析概述8
1.2.1 蛋白质亚细胞多位置预测8
1.2.2 抗微生物肽的多功能类型识别13
1.3 本书的研究内容15
1.4 本书的组织结构18
第2章 蛋白质亚细胞多位置预测中多标记数据建模方法的比较分析20
2.1 本章引言20
2.2 特征表示22
2.3 多标记数据建模方法介绍24
2.3.1 问题表述24
2.3.2 利用标记间相互关系的建模预测方法25
2.3.3 利用标记相关特征的建模预测方法27
2.4 实验设置29
2.4.1 数据集29
2.4.2 性能评价指标31
2.4.3 实验配置32
2.5 实验结果和分析32
2.6 真核蛋白质多位置预测器36
2.7 病毒蛋白质多位置预测器39
2.8 本章小结40
第3章 基于随机标记选择的蛋白质亚细胞多位置预测41
3.1 本章引言41
3.2 特征表示42
3.2.1 伪氨基酸组成PseAAC42
3.2.2 基于自动协方差转换的位置相关得分矩阵PSSM-AC43
3.3 基于随机标记选择的建模预测算法RALS44
3.4 实验设置49
3.4.1 数据集49
3.4.2 参数配置50
3.5 实验结果和分析50
3.5.1 RALS参数对性能的影响51
3.5.2 位置间关系对性能的影响53
3.5.3 与已有预测器的性能比较54
3.5.4 多位置复杂度对性能的影响56
3.6 本章小结58
第4章 结合标记间关系与标记相关特征的蛋白质亚叶绿体多位置预测59
4.1 本章引言59
4.2 叶绿体蛋白质数据集62
4.3 特征表示63
4.4 结合标记间关系与标记相关特征的建模预测算法64
4.5 在线预测服务网站68
4.6 实验结果和分析69
4.7 本章小结70
第5章 基于最优多标记集成分类器的多功能抗微生物肽的识别72
5.1 本章引言72
5.2 抗微生物肽数据集74
5.3 最优多标记集成分类器75
5.3.1 MLkNN分类器76
5.3.2 最优多标记集成77
5.4 在线预测服务网站79
5.5 实验结果和分析80
5.6 本章小结82
第6章 在线生物信息服务网站84
6.1 本章引言84
6.2 构建在线生物信息服务平台84
6.3 在线生物信息服务网站列表85
6.4 使用举例86
6.5 本章小结87
第7章 总结与展望88
7.1 总结88
7.2 展望89
附录 基于遗传算法的相关特征和标记的选择91
参考文献93
后记110